Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP31Q70CQ4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP31Q70CQ4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
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