Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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