Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms