Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CWC27Q6UX04 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CWC27Q6UX04 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms