Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.6 ms