Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms