Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms