Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms