Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ETFRF1Q6IPR1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms