Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL2Q6F5E8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms