Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG16L1Q676U5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG16L1Q676U5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms