Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF123Q5XPI4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms