Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms