Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD13Q5VXD3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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