Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRPF38BQ5VTL8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms