Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TMEM78Q5T7P6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms