Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD1Q5SYB0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms