Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms