Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
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