Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms