Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms