Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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