Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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