Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B3Q16720 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms