Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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HIF1AQ16665 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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