Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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