Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms