Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RPE65Q16518 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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RPE65Q16518 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPE65Q16518 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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