Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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