Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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