Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA2Q15822 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms