Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms