Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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