Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms