Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EEA1Q15075 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EEA1Q15075 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms