Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ARHGEF6Q15052 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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