Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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