Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHPRHQ149N8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHPRHQ149N8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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