Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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NR1D2Q14995 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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NR1D2Q14995 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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NR1D2Q14995 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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NR1D2Q14995 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR1D2Q14995 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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