Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms