Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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