Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MELKQ14680 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MELKQ14680 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MELKQ14680 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MELKQ14680 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MELKQ14680 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MELKQ14680 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MELKQ14680 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MELKQ14680 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MELKQ14680 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MELKQ14680 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MELKQ14680 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MELKQ14680 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MELKQ14680 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms