Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLF9Q13886 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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