Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2Q13563 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms