Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC1Q13547 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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