Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPM6BQ13491 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms