Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCOF1Q13428 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCOF1Q13428 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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