Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TARBP1Q13395 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TARBP1Q13395 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms