Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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