Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF5Q13243 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF5Q13243 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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